L’annonce de DeepMind concernant la sortie de la troisième version de son logiciel AlphaFold marque une avancée majeure dans le domaine de la biologie structurale et de l’intelligence artificielle (IA). AlphaFold3, basé sur l’apprentissage automatique, vise à modéliser de manière précise la façon dont les protéines se replient, ouvrant ainsi la porte à une meilleure compréhension des processus biologiques fondamentaux.
La séquence d’acides aminés, aussi connue sous le nom de séquence primaire, se présente en effet comme une longue chaîne linéaire qui doit se plier dans une configuration complexe et unique pour devenir fonctionnelle. Le processus de repliement est influencé par des forces chimiques et physiques variées, telles que les interactions hydrophobes, les liaisons hydrogène et les forces de Van der Waals. De plus, le repliement se produit dans un environnement cellulaire complexe où des interactions avec d’autres molécules et conditions locales peuvent également jouer un rôle. Les protéines peuvent donc adopter une vaste diversité de structures. En outre, de petites variations dans la séquence d’acides aminés peuvent conduire à des différences significatives dans la structure finale.